Aminosäuren werden über die Peptidbindung zu langen Ketten (Polypeptiden) verknüpft, die als Proteine bezeichnet werden. Eine genau festgelegte Anordnung (Sequenz) - aus etwa 20 verschiedenen ausgewählten - Aminosäuren bestimmt dann die biologischen Eigenschaften des Proteins. Die Kettenlänge der Proteine ist unterschiedlich. Im Mittel enthält ein Protein eine Sequenz von rund 400 Aminosäuren. Jede Aminosäuresequenz, die deshalb als Buchstabenkombination im molekularen Alphabet der Proteinstruktur aufzufassen ist, wird durch die entsprechende Sequenz der Nukleinbasen der DNA festgelegt (codiert).